三国志13可以扮演君主也可以是任意一名武将，玩家可选择不同剧本，剧本按设定史实和虚构两类。从剧本登场武将中选择其一扮演，帮助所属势力统一天下。战斗画面采用近似即时战略的方式，其中武将的技能起到了非常重要的作用。武将人际关系是本作的一大要素，通过专门的人物关系图来直观显示，和其他武将亲密感达到一定程度时有可能缔结羁绊效果。