1. 合生元益生菌奶味和原味的主要区别在于口感。奶味版口感更加浓郁，甜味更强，而原味则更加清淡。

2. 在营养价值方面，两种版本的基本营养成分相同，包括益生菌、蛋白质、碳水化合物、脂肪和维生素和矿物质等。

3. 在保质期方面，奶味版的保质期通常比原味的长，因为添加了额外的糖分和乳制品，稳定性更好。

4. 在使用方法上，两种版本略有不同。奶味版更适合用于调制乳品，例如加入牛奶中，而原味则更适合直接服用。

总结起来，合生元益生菌奶味和原味的主要区别在于口感和营养价值。消费者可以根据自己的口味偏好和需求选择适合自己的版本。