1.原料不一样有机酱油使用有机大豆(有机豆粕)和有机小麦(有机面粉、有机麸皮)普通酱油使用普通原料2.添加剂不一样有机酱油只能使用在有机国标附录上标明可以使用的辅料和添加剂(都是天然无公害或者生产过程不使用现代生物技术和化学处理)，普通酱油只要符合添加剂使用国标就可以了。3.生产过程不一样有机酱油生产过程必须使用非转基因非诱变菌种，生产过程中不能使用任何化学处理。普通酱油没有这方面要求。
